Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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Cdkl1Q8CEQ0 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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