Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
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