Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Pramef8Q8CE24 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Pramef8Q8CE24 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Pramef8Q8CE24 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Pramef8Q8CE24 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Pramef8Q8CE24 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Pramef8Q8CE24 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Pramef8Q8CE24 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Pramef8Q8CE24 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Pramef8Q8CE24 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Pramef8Q8CE24 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Pramef8Q8CE24 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Pramef8Q8CE24 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pramef8Q8CE24 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms