Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Znf428Q8C1M2 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Znf428Q8C1M2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Znf428Q8C1M2 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Znf428Q8C1M2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Znf428Q8C1M2 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Znf428Q8C1M2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Znf428Q8C1M2 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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Znf428Q8C1M2 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Znf428Q8C1M2 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf428Q8C1M2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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