Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms