Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms