Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp40Q8BWR4 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms