Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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