Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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