Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pnma8aQ80VM8 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms