Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shq1Q7TMX5 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shq1Q7TMX5 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms