Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms