Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smchd1Q6P5D8 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms