Protein–RNA interactions for Protein: Q60769

Tnfaip3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip3Q60769 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Tnfaip3Q60769 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Tnfaip3Q60769 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Tnfaip3Q60769 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfaip3Q60769 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Tnfaip3Q60769 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfaip3Q60769 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Tnfaip3Q60769 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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