Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms