Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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