Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Itgb8Q0VBD0 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Itgb8Q0VBD0 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms