Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms