Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GscQ02591 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GscQ02591 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GscQ02591 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GscQ02591 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GscQ02591 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GscQ02591 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GscQ02591 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GscQ02591 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GscQ02591 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GscQ02591 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GscQ02591 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GscQ02591 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GscQ02591 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GscQ02591 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GscQ02591 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GscQ02591 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GscQ02591 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GscQ02591 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GscQ02591 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GscQ02591 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GscQ02591 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GscQ02591 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
GscQ02591 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
GscQ02591 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
GscQ02591 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
GscQ02591 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
GscQ02591 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
GscQ02591 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
GscQ02591 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
GscQ02591 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
GscQ02591 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
GscQ02591 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
GscQ02591 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GscQ02591 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GscQ02591 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms