Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms