Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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