Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rps29P62274 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms