Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp25P57080 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms