Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TspoP50637 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TspoP50637 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TspoP50637 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TspoP50637 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TspoP50637 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TspoP50637 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms