Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbrP50284 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms