Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
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Tmod1P49813 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Tmod1P49813 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Tmod1P49813 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Tmod1P49813 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Tmod1P49813 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Tmod1P49813 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Tmod1P49813 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms