Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TP20293 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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TP20293 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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