Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18533 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18533 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18533 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
P18533 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18533 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18533 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18533 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18533 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18533 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18533 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18533 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18533 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18533 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18533 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18533 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms