Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 M1ap-201ENSMUST00000113980 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Irf1P15314 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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