Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Trio-210ENSMUST00000227337 6375 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Mrps14-203ENSMUST00000135680 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Lamp2-202ENSMUST00000061755 3604 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 D130017N08Rik-202ENSMUST00000180951 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Adam17-201ENSMUST00000064536 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Olfr1512-202ENSMUST00000214980 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Fbxo7-204ENSMUST00000130320 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms