Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms