Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TsksO54887 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TsksO54887 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TsksO54887 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TsksO54887 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TsksO54887 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TsksO54887 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TsksO54887 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TsksO54887 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TsksO54887 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm44146-201ENSMUST00000203508 816 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TsksO54887 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TsksO54887 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TsksO54887 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TsksO54887 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
TsksO54887 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TsksO54887 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TsksO54887 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TsksO54887 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TsksO54887 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TsksO54887 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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