Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pot1bH7BX60 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.5 ms