Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms