Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms