Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Mbnl1-203ENSMUST00000191747 4046 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Rnf217D3YYI7 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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