Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms