Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms