Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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Tgm1Q9JLF6 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Tgm1Q9JLF6 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Tgm1Q9JLF6 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Tgm1Q9JLF6 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Tgm1Q9JLF6 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Tgm1Q9JLF6 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Tgm1Q9JLF6 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Tgm1Q9JLF6 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Tgm1Q9JLF6 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Tgm1Q9JLF6 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Tgm1Q9JLF6 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Tgm1Q9JLF6 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Tgm1Q9JLF6 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms