Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ube3bQ9ES34 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ube3bQ9ES34 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ube3bQ9ES34 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ube3bQ9ES34 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ube3bQ9ES34 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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