Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Smg9Q9DB90 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Smg9Q9DB90 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms