Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms