Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms