Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms