Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms