Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms