Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdac9Q99N13 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Hdac9Q99N13 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Hdac9Q99N13 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Hdac9Q99N13 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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