Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms