Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Rnf144aQ925F3 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Rnf144aQ925F3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Rnf144aQ925F3 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Rnf144aQ925F3 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Rnf144aQ925F3 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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