Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trappc12Q8K2L8 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trappc12Q8K2L8 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trappc12Q8K2L8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trappc12Q8K2L8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trappc12Q8K2L8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trappc12Q8K2L8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trappc12Q8K2L8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trappc12Q8K2L8 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trappc12Q8K2L8 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc12Q8K2L8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms